Здравствуйте!
В соответствии со ст. 207 Налогового кодекса РФ налогоплательщиками налога на доходы физических лиц признаются физические лица, а значит к таковым относятся и индивидуальные предприниматели.
Пунктом 1 ст. 219 Налогового кодекса РФ предусмотрено право налогоплательщика на получение социального налогового вычета в сумме, потраченной им на обучение, при наличии условий, одним из которых то, что индивидуальный предприниматель является плательщиком налога на доходы физических лиц, так как данный вычет предоставляется лицам - плательщикам НДФЛ. Следовательно, если предприниматель не является плательщиком НДФЛ, а находится, например, на упрощенной форме налогообложения, он не имеет право на получение данного вычета.

Суть в следующем: если у Вас есть какой-либо доход, облагаемый по ставке 13%, то именно этот налог и можно вернуть. Сейчас практически все предприниматели находятся на "упрощёнке" (а это 6 или 15%) или вообще на "вменёнке", т. е. нет такого дохода, который бы облагался по ставке именно 13%.

Таким образом, фактически у индивидуального предпринимателя, не возникает права на получение налогового вычета. Однако, предприниматель может где-то ещё работать дополнительно и уже там получать доход, облагаемый по ставке 13%.